故事讲述了茫茫大海中的一个黑暗丛林里，年轻的男孩马可正在逃离可怕的巫师和他的猿猴军队。逃跑途中，马可偷到一颗能够在满月时分实现愿望的魔法钻石。但不久之后，声名狼藉的剑齿虎船长听说了这颗神奇的钻石，决定率领海盗团将这颗钻石夺走。

以意大利为舞台的上一季播放过后2年──鲁邦和他的伙伴们回来了！这次鲁邦三世与次元大介身在法国。故事从一个乡下小镇的公寓里开始。不论是毒品还是枪等非法物品，在「马可波罗」买的到任何东西。鲁邦为了偷取这个网站交易使用的电子货币，入侵了警备森严的巨大云端数据中心，并在那里与天才黑客少女艾米相遇了。虽然鲁邦与艾米起身对抗马可波罗，因为敌人挑起的「鲁邦游戏」，鲁邦开始被全世界的人追捕……。随着艾米的身世逐渐明朗，以及知道鲁邦过去的男人的出现──鲁邦将面临前所未有的困境！

在古老的香都王国，意大利旅行家马可-波罗告别可汗，准备返回自己的家乡。为维护友谊，可汗欲将充满神奇力量的魔法金币送给他。不料，对王位垂涎已久的大臣福林却寻机偷走金币，随后便隐匿无踪。可汗得知真相后，将