本剧讲述的是嘉靖与海瑞的故事。嘉靖三十九年，贪墨横行、民不聊生。奸臣严嵩（倪大红 饰）党羽密布、权倾朝野，清官海瑞（黄志忠 饰）不惧强权，敢于向腐朽封建的皇权发起挑战。皇帝朱厚熜（陈宝国 饰）练道修玄...

明末清初，乱世纷争。天启帝的太子朱慈燃从襁褓中便流落民间。天启7年，天启帝暴毙。同年，其弟信王朱由检继位，改年号崇祯，自崇祯元年起明王朝烽烟四起，闯王李自成，后金努尔哈赤纷纷起兵与明王朝分庭抗礼，崇祯帝一败涂地。流离失所的皇长子朱慈燃成为各政派系争夺的对象.为保太子平安，明朝忠臣冷延泉在民间寻回太子，并将其安排在灵岩寺假意出家为僧，不曾想风声走漏，已归顺清王朝的杭州织造局掌印大太监刘明喜带着大批锦衣卫杀上了灵岩寺，此后汉阳城左家军，大顺李自成亦是蠢蠢欲动。