《念念手纪》主要讲述了男主角志贺春树（北村匠海饰）因为偶然间捡到了同班同学山内樱良（滨边美波饰）的手纪，而发现了她身患胰脏绝症的秘密。性格天差地别的两人也因此走近，一同度过了樱良生命中最后一段时光。影片以12年后志贺春树（小栗旬饰）回忆的形式展开，与即将结婚的樱良好友恭子（北川景子饰）一起表达对樱良的追忆和思念。

该片改编自同名漫画，主人公花垣武道（北村匠海 饰）因被推下月台意外穿越到10年前，他为了拯救被“东京卍会”杀害的女友，决定向该不良组织发起挑战。